Der Nervus glossopharyngeus tritt zusammen mit den Nerven N. vagus und N. acesorius durch das Foramen jugulare. Vor dem Durchtritt befindet sich das Ganglion superior, danach das Ganglion inferior.
Am unteren Ganglion entspringt der Nervus tympanicus, welcher mit Fasern des Nervus facialis den Plexus tympanicus bildet. Dort zweigt beispielsweise der Nervus petrosus minor ab.
Weitere Aufgaben des Nervus glossopharyngeus sind die Versorgung der Rezeptoren im Glomus caroticum (Chemorezeptoren) und Sinus caroticus (Presso-/Barorezeptoren). Außerdem werden die Mandeln von ihm innerviert. Sowohl sensorisch als auch sensibel versorgt er außerdem das hintere Zungendrittel.
Motorisch innerviert der 9. Hirnnerv die Pharynxmuskulatur (Schlundheber und Konstriktoren), den Musculus levator veli palatini, den Musculus palatoglossus und den Musculus uvulae.
